השלמת כיבוש הארץ לוותה במורכבויות ובפשרות מול יושבי הארץ המקוריים. המילים וְלֹא הוֹרִישׁוּ מכוונות לבני אפרים, אשר נמנעו מגירוש הכנענים שישבו בְּגָזֶר. עיר זו הייתה עיר מבצר חשובה שלא נכבשה בידי ישראל [ביאור שטיינזלץ], והיא נכללה בתוך נחלת שבט אפרים. לגבי מיקומה המדויק בנחלה, גזר עמדה על הגבול הנמתח מתפוח ועד לים [מצודת דוד], ונחשבה לחלק מחלקו של אפרים בתוך הערים המובדלות [מלבי"ם].
במקום לגרש את הכנענים, נוצר מצב של חיים משותפים בתנאי שעבוד. המונח לְמַס עֹבֵד אינו מתייחס לתשלום של מס כספי, אלא למס של עבודת כפייה פיזית בגוף [מצודת דוד]. עבודת כפייה זו הוטלה על יושבי גזר הכנענים, ובתמורה לכך התאפשר להם להמשיך ולהתגורר בעיר תחת חסותו של שבט אפרים [ביאור שטיינזלץ].