הגעתם של האנשים אל העיר הופכת למלכודת מוות מתוכננת ואכזרית. מיד עם כניסתם, הם נרצחים ומושלכים אל בור, במהלך שנועד לשרת את מטרות ההישרדות של הרוצח.
בבחינת נוסח הכתוב, קיימת התייחסות למסורת הכתיב של המילה כְּבוֹאָם, וישנו דיון האם היא נכתבת בכתיב מלא עם האות וי"ו או בכתיב חסר [מנחת שי].
הפרשנים מסכימים כי המניע למעשה הרצח המתואר במילה וַיִּשְׁחָטֵם היה הסתרה. ישמעאל בן נתניה ביקש למנוע מהאנשים לגלות את דבר הירצחו של גדליה, כדי שהשמועה לא תתפשט וכך ימנע מצב שבו ירדפו אחריו [מצודת דוד, ביאור שטיינזלץ].
פעולת ההסתרה נמשכת בהשלכת הגופות אֶל תּוֹךְ הַבּוֹר, שהיה כבר מוכן וקיים במקום [מצודת דוד]. מעשה הטבח עצמו לא בוצע על ידי ישמעאל לבדו, אלא הוּא וְהָאֲנָשִׁים אֲשֶׁר אִתּוֹ חברו יחד וביצעו את הרצח במשותף [מצודת דוד].