בתיאור נחלות הלוויים עולה קושי מספרי בולט הנוגע לערים שניתנו לבני מררי. אף על פי שבתחילת הפירוט נאמר כי בני מררי קיבלו שתים עשרה ערים משבטי זבולון, גד וראובן, בפועל מפורטות רק שמונה ערים – ארבע מזבולון וארבע מגד, ואילו הערים ממטה ראובן חסרות [רד"ק, מנחת שי].
בשל חוסר זה, קיימים הבדלי נוסחאות משמעותיים בין ספרי התנ"ך השונים. בחלק מהספרים והדפוסים הישנים נוספו שני פסוקים המיישרים את החשבון ומונים ארבע ערים ממטה ראובן: בצר, יהצה, קדמות, ומיפעת (או מופעת). בחלק מכתבי היד הישנים אף מופיעה תוספת המגדירה את העיר הראשונה כעיר מקלט, במילים את עיר מקלט הרצח את בצר [מנחת שי]. תוספת זו של הפסוקים החסרים תואמת לחלוטין את הרשימה המקבילה המופיעה בספר דברי הימים [רד"ק, מנחת שי].
עם זאת, הפרשנים מדגישים כי מדובר בהגהה ותוספת מאוחרת. בספרים הישנים והמדויקים ביותר, פסוקים אלו אינם מופיעים כלל [רד"ק]. כדי ליישב את הסתירה בין סך הערים המוצהר לבין הפירוט החסר בספר יהושע, מובאת תשובתו של רב האי גאון. לדבריו, הפסוקים אכן לא נכתבו במקור בספר יהושע, והכתוב סומך על כך שערים אלו מנויות ומפורטות בספר דברי הימים, ולכן לא היה צורך לחזור ולמנותן כאן [רד"ק, מנחת שי].