תהליך חנוכת חומת ירושלים דרש הכנה רוחנית ופיזית קפדנית, שהתבצעה בשלבים מן הפנים אל החוץ. השלב הראשון החל בהנהגה הרוחנית. כאשר הכתוב אומר וַיִּטַּהֲרוּ, הכוונה היא שהכהנים והלויים טיהרו קודם כל את עצמם על ידי טבילה מטומאתם [מצודת דוד]. רק לאחר שנטהרו בעצמם, הם יכלו לפנות ולטהר את האחרים [רש"י, רלב"ג]. מבחינת נוסח המקרא, האות טי"ת במילה זו מנוקדת בפתח [מנחת שי].
בשלב השני, וַיְטַהֲרוּ אֶת הָעָם, הכהנים והלויים פעלו לזרז את העם ולעודד אותם לטהר את עצמם [מצודת דוד].
השלב השלישי והאחרון הוקדש למרחב הפיזי של העיר. הפרשנים מסכימים כי טהרת הַשְּׁעָרִים וכן הַחוֹמָה נועדה לסלק ולנקות כל טומאה ומיאוס מן המבנים, כדי שלא תישאר כלל טומאה בעיר. בעניין זה קיימת הערת נוסח, ולפיה באחד הדפוסים הישנים נכתב בטעות "השוערים" במקום הַשְּׁעָרִים, אך זהו שיבוש ויש לקרוא את המילה כפי שהיא מופיעה לפנינו [מנחת שי].