התכנסות בעלי החיים אל התיבה לא הייתה מסע ציד אנושי, אלא אירוע פלאי שבו הטבע עצמו נענה לצו האלוהי. הגישה המרכזית בקרב רוב הפרשנים היא שהמילה בָּאוּ מדגישה כי החיות הגיעו אל התיבה מאליהן, ללא מאמץ מצדו של נח. עובדה זו מעוררת שאלה, שהרי במקומות אחרים נצטווה נח להביא את החיות, לשון המרמזת על פעולה אקטיבית. הפרשנים מסבירים כי בעלי החיים הגיעו בכוחות עצמם מן היערות והמדבריות אל סביבת התיבה, ותפקידו של נח הסתכם בהכנסתם פנימה אל תוך התיבה עצמה, או בקריאה אליהם לבוא [מזרחי, רד"ק, גור אריה]. הגעה ספונטנית זו פתרה עבור נח את הקושי העצום לברור אילו חיות להכניס מבלי לגרום למהומה או לפגיעה באלו שיישארו בחוץ [שפתי חכמים]. מתוך אירוע זה עולה תובנה עמוקה: ה׳, אשר נתן לנח את הציווי, הוא גם השולט בטבע ומכוון אותו כדי לאפשר לאדם לקיים את הציווי, ובכך מתאחדים אלוהי המוסר והאנושות עם אלוהי הטבע והבריאה [רש"ר הירש].
באשר לביטוי שְׁנַיִם שְׁנַיִם, הפרשנים מתמודדים עם הסתירה לכאורה לציווי הקודם להביא שבעה מכל מין טהור. קיימות מספר גישות ליישוב הדבר:
גישה אחת מסבירה כי הפסוק מציין את המינימום ההכרחי; כל המינים הושוו בכך שמן הפחות ביותר הגיעו לפחות שניים [רש"י, מזרחי, שפתי חכמים, ברכת אשר, שטיינזלץ].
גישה שנייה מפרשת שהביטוי אינו מתייחס לכמות הכוללת, אלא לאופן ההגעה – החיות לא הגיעו בערבוביה, אלא בזוגות מסודרים של זכר ונקבה, וזאת גם בקרב המינים הטהורים שמהם הגיעו שבעה זוגות [רד"ק, יריעות שלמה, גור אריה, העמק דבר].
גישה שלישית מציעה כי זוגות רבים הגיעו מאליהם אל נח, ומתוכם הוא בחר זוג אחד מכל מין טמא ושבעה זוגות מכל מין טהור [ביאור יש"ר].
גישה נוספת מחלקת בין המטרה שלשמה נכנסו החיות: שניים מכל מין הגיעו מאליהם מאת ה׳ כדי להבטיח את קיום המין, ואילו את יתרת חמשת הטהורים, שנועדו להקרבת קורבנות ולא להמשכיות הבריאה, נדרש נח לטרוח ולהביא בעצמו [אור החיים]. עם זאת, יש החולקים על כך וסוברים שגם החיות הטהורות הנוספות הגיעו מאליהן [העמק דבר].
הדגשת הפסוק כי החיות באו זוגות של זָכָר וּנְקֵבָה מעוררת שאלה לגבי המינים הטהורים: מדוע נדרש שוויון מספרי בין זכרים ונקבות, בניגוד לדרך הטבע שבה זכר אחד מספיק לנקבות רבות לשם רבייה? התשובה לכך היא שהזכרים העודפים מהמינים הטהורים לא נועדו לרבייה, אלא להקרבת עולות לה׳ לאחר המבול, ועל פי ההלכה קורבן עולה חייב להיות זכר [בכור שור].